Määrus sätestab asutuse teenistujateametnike ja töötajate, kelle koosseis, koondandmed või konkreetsed tööülesanded on riigisaladus (edaspidi salastatud töötaja), sotsiaalmaksu arvutamise ning tulumaksu, kohustusliku kogumispensionide makse ja töötuskindlustusmakse arvutamise ja kinnipidamise korra.
Salastatud töötajale tehtud väljamaksetelt tulu- ja sotsiaalmaksu ning töötuskindlustus- ja kohustusliku kogumispensionide makse arvutamine (edaspidi maksuarvestus) toimub asutuse valikul: 1) asutuse kaudu üldises maksuarvestuse korras; 2) variisiku, salajase koosseisulise ametniku või töötaja, teeseldud isiku, välisriigi äriühingu filiaali, asutuse, struktuuriüksuse või organi või julgeolekuasutuse kasutatava eraõigusliku juriidilise isiku kaudu üldises maksuarvestuse korras; 3) salastatud töötaja registreerimisega äriregistris füüsilisest isikust ettevõtjana.
Rahandusministri 16[Käesolevast tekstist välja jäetud. oktoobri 2003. a määrus nr 94 „Julgeolekuasutuste teenistujate tulumaksu, sotsiaalmaksu ja töötuskindlustusmakse arvestamise kord” (RT I, 28.01.2011, 10) tunnistatakse kehtetuks.]